Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms