Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHC1P29353 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms