Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RCE1Q9Y256 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms