Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps4Q99KG7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps4Q99KG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms