Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms