Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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