Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms