Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA3P52797 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms