Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms