Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00472Q9H8W2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms