Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc130Q9D516 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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