Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms