Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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