Protein–RNA interactions for Protein: Q99N94

Mrpl9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl9Q99N94 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl9Q99N94 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl9Q99N94 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms