Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRKLP46109 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRKLP46109 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRKLP46109 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRKLP46109 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRKLP46109 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms