Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPARGP37231 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPARGP37231 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms