Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX5BP10606 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX5BP10606 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX5BP10606 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX5BP10606 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms