Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSH5O43196 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms