Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT172Q9UG01 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT172Q9UG01 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms