Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp3Q9CQ10 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms