Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms