Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms