Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubash3bQ8BGG7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ubash3bQ8BGG7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubash3bQ8BGG7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubash3bQ8BGG7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ubash3bQ8BGG7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms