Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf187Q8BFX1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf187Q8BFX1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rnf187Q8BFX1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf187Q8BFX1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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