Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbp4Q61107 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp4Q61107 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms