Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema5bQ60519 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms