Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP6Q5VW22 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms