Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PERM1Q5SV97 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms