Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD1Q16676 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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FOXD1Q16676 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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FOXD1Q16676 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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FOXD1Q16676 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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FOXD1Q16676 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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FOXD1Q16676 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD1Q16676 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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