Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FXNQ16595 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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