Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPTX1Q15818 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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