Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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