Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms