Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN7AQ01118 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms