Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHBP55084 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHBP55084 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms