Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms