Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR2C1P13056 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms