Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh2d1bO35324 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms