Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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USP18Q9UMW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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USP18Q9UMW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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USP18Q9UMW8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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USP18Q9UMW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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USP18Q9UMW8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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