Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms