Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP9XQ93008 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms