Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF3AQ92664 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms