Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms