Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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