Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms