Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ME3Q16798 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ME3Q16798 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ME3Q16798 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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