Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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MKRN4PQ13434 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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MKRN4PQ13434 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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