Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms