Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERVK_113P63121 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms