Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGAEP38570 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms